美妙旋律第三季故事是发生在第一季的七年以后、第二季的四年以后，美爱等人已经从pretty top毕业并且学有所成。本作将有别于前作，以平行世界的东京、原宿作为舞台，原本只以"流行"及"舞蹈"为比赛中心的内容，更增添了一项新的"音乐"要素，描述一群能感知音乐的颜色、热度和味道的主角们，站上星光舞台达成梦想的故事。 主角彩濑奈露是个只要听音乐就能感受到声音的颜色，想像力丰富的中学二年级女孩，擅长装饰各式小物擅长装饰各式小物，梦想是希望能够开一间如「Dear Crown」那样引领时尚潮流的店。一天，她得知了即将开设的新店铺，将募集会跳三棱镜舞蹈的女中学生作店长。奈露也参加了甄选，并在众多参加者中脱颖而出，一路来到了最终面试。
故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为人迷迷糊糊，对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友，他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚。当然，以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物，乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏…… 本片根据漫画家尼子騒兵衛原著《落第忍者乱太郎》改编，改编成动画时，因NHK电视台的禁忌而将“落第”二字去掉。
新一届全大陆高级魂师斗魂大赛即将开始，史莱克七怪在玄老的建议下代表唐门出战。霍雨浩修炼中途偶然在天梦的帮助下打开了牛天给的锦囊，知晓了王冬有致命暗伤这一秘密，并决意冒险为王冬摘取相思断肠草，出发时被王秋儿看到霍雨浩无奈让她同行。落日森林危机四伏，霍雨浩为拿到相思断肠草险些丧命，更加确定了自己对王冬的心意。回到史莱克后，霍雨浩经历多次救治也没能全部恢复，只能以半残的身体上阵。
普通的应届大学毕业生夏铃在求职之际，收到了一条奇怪的面试通知，因此误入罗刹街并遭到了危险，幸而被镇魂将曹焱兵搭救。然而接触中，曹焱兵却发现夏铃并非看起来那样普通，因为她的身体里也存在着灵力，并且寄宿着一位神秘的守护灵。与此同时，夏铃开始遭到不明身份刺客的追杀，曹焱兵亦被卷入其中，二人的命运从此开始了交集，而在这一切的背后，似乎还隐藏着某些更加危险的秘密……
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中野（诹访部顺一 配音）是一个标标准准的社畜，在黑心公司上班的他每一天都会受到老板无情的压榨，下班后筋疲力尽的回到家中，等待着他的是冷冷清清的黑暗房间，还有一堆因为没有精力做而放置在那里的家务。对于未来，中野看不到一点希望，他只是闭着眼睛过着眼前的一天又一天而已。 一天，和往常一样，中野闷闷不乐的回到家中，让他没有想到的是，一只小狐仙（和气杏未 配音）就这样出现在了他的视野之中，在误打误撞之中突如其来的狐仙不忍心看到中野颓废的现状，于是暂住在他家，担负起了打理家事的责任。有了小狐仙，中野每天回家的脚步似乎变得轻快了一些。
