因双亲要在海外出差，所以一人留在日本的主人公以一年为期限住在了舅父的家里。之后转校到八十神高中的他得知一个深夜电视的传言在雨夜的十二时，只要看着关闭着的电视屏上自己的脸，就会浮现出另一个人的映像。主人公与同伴为了确认这一传言是否属实，不料被拉进了异空间，在那里被称为暗影的怪物袭击，与怪物接触时主角一行人的Persona能力觉醒。为了掘开深夜电视与连续杀人事件之间的关系，以及避免其他人被卷入该事件，他们组成了特别搜查队展开了战斗。
这里是，“人”“神”“魔”各种族混杂的神秘世界密斯塔尔希亚。 世界免于巴哈姆特复活引发的崩坏，在那之后过了10年—— 新的“人”之王袭击“神”之神殿，攻陷“魔”之国度。 从濒临毁灭的状况得到复兴以及更进一步的发展，王都为“人”带来了财富。 作为王都复兴的食粮而沦为奴隶的“魔”，以及随着信仰心的消失而失去力量的“神”。 在逐渐失去均衡的世界中，“人”“神”“魔”各自的正义相互交错……
为揭开秦烈里魂的秘密，本季中时光将回朔到秦烈刚刚加入器具宗外宗之时。彼时秦烈经李牧指点，为了寻找凌语诗，秦烈排除障碍通过了器具宗试炼，加入外宗。在唐思琪的指点下开始进行日常修炼。 由于在入宗考试中惹恼了唐思琪，秦烈在宗门内的生活处处被大师姐刁难。天长日久，二人之间竟然产生了一些不可名状的情愫。而这些也都被意图篡取宗门之位的梁少扬看在了眼里。期初梁少扬只是为了宗主之位接近唐思琪，但经过一段日子的接触，梁少扬也对大师姐产生了特殊的感觉……
交锋联盟…那是所有斗士梦寐以求的顶点之战。 现在，就在这个瞬间，在各个『战区』中，赌上交锋联盟出场权的热血预选赛正如火如荼地展开。其中一个战区『GGG』，也正在开展预选赛『机巧一族杯』，斗士们利用自己引以为傲的机械装置展开激斗。 获胜的关键在于和队友们的联机，以及战略。 能够轻松挥舞巨大机械装置的少女“板手G 莲琪”所率领的「涡流」，也是其中一支追梦的队伍。但是，在热斗正酣之时，一位神秘的少女闯了进来。这一次邂逅，将会逐渐改写莲琪、涡流以及GGG的命运！
原罪游戏降临现实世界，改变了所有人的正常生活。父母离奇失踪的楚夕冥冥中成为了天选之人，在游戏中获得了最高的消费权限。原罪游戏里危机四伏，离奇的事件，诡异的未知生物，以及随机的副本任务......幸好楚夕是原罪游戏中最富有的玩家，当别人还在千辛万苦求生的时候，楚夕已经靠着万亿功德值把游戏氪爆了！随着不断探知原罪游戏的的内容，楚夕也距离父母失踪的真相越来越近...
成为女王的梦想、将来的梦想，都不想放弃！将一生赌在这一瞬间上—— 高中2年级的夏天，千早所在的歌留多部与新入部员一同在全国大赛中出场。在团体战中击败了常胜校·富士崎高中，瑞泽高中获得期待已久的初次优胜，而个人战中太一和新也获得了B级和A级的优胜。千早在团体战中受伤的右指的手术也顺利结束，和太一一起参加了富士崎高中的夏季合宿。对顾问樱泽老师的斯巴达指导毫不在意，以名人·女王战为目标努力练习，但就在此时，他们得知了让出场变得危险的某个事实……另一方面，新了解到拥有团队可以扩展歌留多的可能性，于是他开始准备创立歌留多部.新的对手登场，今后的出路，成为女王的梦想……纯正的高中生一心一意的心念和热情满溢而出的第3期开幕！
