这里是，“人”“神”“魔”各种族混杂的神秘世界密斯塔尔希亚。 世界免于巴哈姆特复活引发的崩坏，在那之后过了10年—— 新的“人”之王袭击“神”之神殿，攻陷“魔”之国度。 从濒临毁灭的状况得到复兴以及更进一步的发展，王都为“人”带来了财富。 作为王都复兴的食粮而沦为奴隶的“魔”，以及随着信仰心的消失而失去力量的“神”。 在逐渐失去均衡的世界中，“人”“神”“魔”各自的正义相互交错……
成为女王的梦想、将来的梦想，都不想放弃！将一生赌在这一瞬间上—— 高中2年级的夏天，千早所在的歌留多部与新入部员一同在全国大赛中出场。在团体战中击败了常胜校·富士崎高中，瑞泽高中获得期待已久的初次优胜，而个人战中太一和新也获得了B级和A级的优胜。千早在团体战中受伤的右指的手术也顺利结束，和太一一起参加了富士崎高中的夏季合宿。对顾问樱泽老师的斯巴达指导毫不在意，以名人·女王战为目标努力练习，但就在此时，他们得知了让出场变得危险的某个事实……另一方面，新了解到拥有团队可以扩展歌留多的可能性，于是他开始准备创立歌留多部.新的对手登场，今后的出路，成为女王的梦想……纯正的高中生一心一意的心念和热情满溢而出的第3期开幕！
西暦1997年、練馬区に住む五十嵐兄弟の前に二人の女性が降って来る。彼女達は電次元から来たルーチンという存在で、その使命は電次元のルールに則り互いに競って勝者が地球征服するということだった。二人は五十嵐兄弟をゲームの観客兼ゲーム後のパートナーとして選ぶが、五十嵐淑を巻き込んで傷つけてしまいルールを侵してしまう。コンパイラはアセンブラとのゲームと無関係に地球征服を遂行してルール違反をチャラにしようとするが、ルーチンは水に弱く、雨が降ったために地球征服は失敗。 以降、特に目的もなく五十嵐家に居候しながら、襲ってくる電次元の刺客をあしらいながら適当に暮らすドタバタの日々を送ることになる。
《Union》是曾经风靡一时的多人在线角色扮演游戏，一支全部由小学生组成的名为“昴星团”的队伍是游戏中的霸主，所向披靡无人能敌。然而，一场事故的发生导致了小组中一名成员旭姬（大森日雅 配音）的死亡，导致昴星团解散，游戏也被迫下线。 一晃眼多年过去，曾经的昴星团成员如今都已经成为了高中生，这时，一款名为《《Reunion》》的游戏再次闯入了人们的视线。昴星团曾经的前锋天羽阳翔（高梨谦吾 配音）登入游戏，在游戏中意外的发现了旭姬的身影，站在他面前的，究竟只是信息碎片或是青梅竹马的鬼魂？为了完成一个幼年时的约定，昴星团重新聚集在了一起。
