故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为人迷迷糊糊，对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友，他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚。当然，以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物，乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏…… 本片根据漫画家尼子騒兵衛原著《落第忍者乱太郎》改编，改编成动画时，因NHK电视台的禁忌而将“落第”二字去掉。
牧尘，北灵境中史无前例取得“灵路”资格的少年。本应顺利通过“灵路”的试验后进入五大院学习，却史无前例地在灵路试炼中半途被踢了出来，没有人知道原因为何，许多人因此认为他不过是侥幸得到资格。然而牧尘将用实力证明，就算没能在“灵路”中走到最后，他也能夺取五大院的入门资格。
为揭开秦烈里魂的秘密，本季中时光将回朔到秦烈刚刚加入器具宗外宗之时。彼时秦烈经李牧指点，为了寻找凌语诗，秦烈排除障碍通过了器具宗试炼，加入外宗。在唐思琪的指点下开始进行日常修炼。 由于在入宗考试中惹恼了唐思琪，秦烈在宗门内的生活处处被大师姐刁难。天长日久，二人之间竟然产生了一些不可名状的情愫。而这些也都被意图篡取宗门之位的梁少扬看在了眼里。期初梁少扬只是为了宗主之位接近唐思琪，但经过一段日子的接触，梁少扬也对大师姐产生了特殊的感觉……
林千，一个守着末流小丧葬店的落魄老板。当诡异末世骤然降临，秩序崩塌，众生惶恐时，他却凭借店内那些不起眼的纸钱、香烛、骨灰盒……化腐朽为神奇，硬生生在恐怖任务中杀出一条生路！救佳人于危难，打脸各路强敌，更引得桃花朵朵开。谁说丧葬品不吉利？他正用这“晦气”行当，踏出一条打脸与桃花齐飞、逆袭至强的传说之路！
